Κατά τη διάρκεια όλης της σχολικής χρονιάς, ο Φορέας Διαχείρισης, υλοποιεί προγράμματα περιβαλλοντικής εκπαίδευσης.

Αυτά τα προγράμματα έχουν είτε μικρή είτε μεγάλη διάρκεια. Κάθε χρόνο σχεδιάζονται νέα προγράμματα και αφορούν τους μαθητές της ευρύτερης περιοχής του Δέλτα Έβρου, αλλά και όσους μαθητές επισκέπτονται τον υγρότοπο από όλη την Ελλάδα.

Οι μαθητές της περιοχής έχουν τη δυνατότητα να συμμετέχουν σε ετήσια προγράμματα περιβαλλοντικής εκπαίδευσης στα οποία οργανώνονται δραστηριότητες όλο το χρόνο, με επισκέψεις στον υγρότοπο, συνεντεύξεις από παραγωγικούς χρήστες, παρατήρηση πουλιών, συμμετοχή σε βιωματικές δραστηριότητες και πολλά άλλα. Στο τέλος της περιόδου, οι μαθητές κάνουν μια τελική εργασία ή παρουσίαση.

Τα προγράμματα που έχουν μικρότερη διάρκεια μπορεί να είναι ημερήσια ή να περιλαμβάνουν έναν πολυήμερο συνδυασμό ενημερωτικών παρουσιάσεων και διαδρομών στον υγρότοπο. Σχεδιάζονται από το Φορέα Διαχείρισης για όλους τους μικρούς επισκέπτες που έρχονται οργανωμένα στο Δέλτα Έβρου ή μετά από κάποια πρόσκληση που θα απευθύνει κάποιο σχολείο με ένα ειδικό θέμα.

Στα ημερήσια προγράμματα που υλοποιούνται στο Κέντρο Πληροφόρησης οι δραστηριότητες μπορεί να περιλαμβάνουν ενημερωτική προβολή, κατασκευές, ζωγραφική, περιβαλλοντικά παιχνίδια, δραστηριότητες στον υγρότοπο, περιήγηση, παρατήρηση πουλιών και πολλά άλλα.

Τα εκπαιδευτικά προγράμματα προσαρμόζονται πάντα στην ιδιαιτερότητα και τις απαιτήσεις των ομάδων που συμμετέχουν. Ο Φορέας Διαχείρισης έχει αναπτύξει μια πολύ καλή συνεργασία σε τοπικό επίπεδο, με τους εκπαιδευτικούς και τους μαθητές.