Ο Φορέας Διαχείρισης υλοποιεί το Πρόγραμμα Επιστημονικής Παρακολούθησης του Δέλτα Έβρου το οποίο εστιάζει στην παρακολούθηση της ορνιθοπανίδας του Δέλτα και την παρακολούθηση της ποιότητας των υδάτων της περιοχής.
Οι δράσεις που υλοποιεί ο Φορέας σχετικά με την παρακολούθηση της
ορνιθοπανίδας είναι:
1. Παρακολούθηση των σημαντικών ειδών ορνιθοπανίδας με περιοδικές καταγραφές και συσχέτισή των πληθυσμών τους με τα διάφορα είδη οικοτόπων και την χωρική τους κατανομή
2. Παρακολούθηση σημαντικών αναπαραγόμενων ειδών
3. Δακτυλιώσεις διαφόρων ομάδων πουλιών (στρουθιόμορφα, παρυδάτια, υδρόβια)
4. Λειτουργία των κλουβιών παγίδευσης πουλιών την χειμερινή περίοδο, με σκοπό την σύλληψη πουλιών για την συλλογή διαφόρων βιομετρικών δεδομένων και την δακτυλίωσή τους
5. Παρακολούθηση των σημαντικών ειδών αρπακτικών που διαχειμάζουν στο Δέλτα, μέσω καταγραφών που γίνονται στην περιοχή κούρνιας τους στους λόφους του Λουτρού
6. Επεξεργασία των συλλεγόμενων δεδομένων και σύνταξη αναφορών σχετικά με την κατάσταση παρουσίας των διαφόρων ειδών και προτάσεις διαχείρισης
Οι γενικοί στόχοι του προγράμματος επιστημονικής παρακολούθησης για τα είδη ορνιθοπανίδας του προγράμματος συνοψίζονται στα παρακάτω:
1. Συνέχιση της επιστημονικής παρακολούθησης που έχει γίνει τα προηγούμενα έτη, έτσι ώστε να προκύψουν συγκρίσιμες παρατηρήσεις και αποτελέσματα ώστε να οργανωθεί η ορθότερη διαχείριση του περιβάλλοντος
2. Δημιουργία μακροχρόνιων χρονοσειρών δεδομένων για την αποτελεσματική διαχείριση της ορνιθοπανίδας και των βιοτόπων
3. Αποτύπωση της παρούσας κατάστασης των πληθυσμών των ειδών προτεραιότητας και των άλλων σημαντικών ειδών
4. Συσχετισμός της παρουσίας των πουλιών με τα ενδιαιτήματα και την ποιότητα των οικοτόπων, ώστε να διαπιστωθεί ποιες περιοχές χρίζουν μεγαλύτερης προστασίας, ποιες κινδυνεύουν και σε ποιες θα εφαρμοστούν συγκεκριμένες διαχειριστικές δράσεις που θα οδηγήσουν στην βελτίωση των συνθηκών διαβίωσης των εν λόγω ειδών
5. Έγκαιρη ανίχνευση αλλαγών των πληθυσμών των πουλιών ώστε να υπάρχει καλύτερος σχεδιασμός διαχειριστικών δράσεων για τα είδη αυτά
6. Καθορισμός της σημασίας των ενδεχόμενων αλλαγών στους πληθυσμούς των πουλιών για την πορεία του οικοσυστήματος
7. Καθορισμός αποτελεσματικής μεθόδου παρακολούθησης των πουλιών στην περιοχή και δημιουργία ολοκληρωμένου σχεδίου για την συνέχιση της επιστημονικής παρακολούθησης
8. Βελτίωση των επιστημονικών γνώσεων για τα απειλούμενα είδη και τις οικολογικές απαιτήσεις τους σχετικά με τον υγρότοπο
9.Αξιολόγηση όλων των συλλεγόμενων στοιχείων και προτάσεις διαχείρισης βιοτόπων προς όφελος των συγκεκριμένων ειδών ορνιθοπανίδας